Được thành lập từ năm 1978, trước đây bệnh viện mang tên Bệnh viện Điện Biên Phủ, sau đó được đổi tên thành Trung tâm Mắt và được chính thức đổi tên thành Bệnh viện Mắt từ năm 2002. Qua hơn 30 năm phát triển, Bệnh viện mắt TP.HCM hiện nay là trung tâm dẫn đầu về nhãn khoa trong cả nước với chức năng chính là khám, điều trị các bệnh lý về mắt cho nhân dân thành phố Hồ Chí Minh và khu vực miền Nam.